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Type and details of transgene |
Is the transgene Plasmodium derived |
Transgene: not Plasmodium |
Transgene name | GFP-Luciferase |
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Details of the genetic modification |
Inducable system used | No |
Additional remarks inducable system |
|
Type of plasmid/construct | Plasmid double cross-over |
PlasmoGEM (Sanger) construct/vector used | No |
Modified PlasmoGEM construct/vector used | No
|
Plasmid/construct map |
|
Plasmid/construct sequence |
TCGAGAAGAGAAGGAAGACTGACGACGCAGCCACTGCGGAACCGAGCAACGCAATGAGCT
CCTTGACGTCCACGAGGGAGACAACTCCCGTGCACGGGTTGCAGGCTCCTTCTTCGGCCG
CAGCCATTGCCCCGGTGTTGGCGTGGATGGACGAAGAAGACCGGAAAAAACGCGAGCAAA
AGGAACTGATTCGGGCCGTTCCGCATGTTCACTTTAGAGGCCATGAAGAGTTCCAGTACC
TTGATCTCATTGCCGACATTATTAACAATGGAAGGACAATGGATGACCGAACGGGCGTTG
GTGTCATCTCCAAATTCGGCTGCACTATGCGCTACTCGCTGGATCAGGCCTTTCCACTTC
TCACCACAAAGCGTGTGTTCTGGAAAGGGGTCCTCGAAGAGTTGCTGTGGTTCATTCGCG
GCGACACGAACGCAAACCATCTTTCTGAGAAGGGCGTGAAGATCTGGGACAAGAATGTGA
CACGCGAGTTCCTCGATTCGCGCAATCTCCCCCACCGAGAGGTCGGAGACATCGGCCCGG
GCTACGGCTTCCAGTGGAGACACTTCGGCGCGGCATACAAAGACATGCACACAGACTACA
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ATCGTCGCATGCTCATGACTGCCTGGAATCCTGCAGCGCTGGACGAAATGGCGCTGCCGC
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ATCAGCGGTCGTGCGATGTCGGCCTCGGCGTCCCCTTCAACATCGCTTCCTATTCGCTTT
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GGAACACGCATGTCTACACGAACCATGTCGAGGCTTTAAAAGAGCAGCTGCGGAGAGAAC
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GCATAAATATTACTATTTATAATGGCAATTGATATAACGTGCACACACATGCAAAACTAA
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ACCTGTTCCTTGGCCAACACTTGTCACTACTTTCGGTTATGGTGTTCAATGCTTTGCGAG
ATACCCAGATCACATGAAACAGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGT
ACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACGTGCTGAAGTCAA
GTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGA
TGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCAT
GGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTTAACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGA
TGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGT
CCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGA
AAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCAT
GGATGAACTATACAAAGGGATCCTGGCTAGCCAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGCG
GCCGATCCAAATGGAAGACGCCAAAAACATAAAGAAAGGCCCGGCGCCATTCTATCCGCT
GGAAGATGGAACCGCTGGAGAGCAACTGCATAAGGCTATGAAGAGATACGCCCTGGTTCC
TGGAACAATTGCTTTTACAGATGCACATATCGAGGTGAACATCACGTACGCGGAATACTT
CGAAATGTCCGTTCGGTTGGCAGAAGCTATGAAACGATATGGGCTGAATACAAATCACAG
AATCGTCGTATGCAGTGAAAACTCTCTTCAATTCTTTATGCCGGTGTTGGGCGCGTTATT
TATCGGAGTTGCAGTTGCGCCCGCGAACGACATTTATAATGAACGTGAATTGCTCAACAG
TATGAACATTTCGCAGCCTACCGTAGTGTTTGTTTCCAAAAAGGGGTTGCAAAAAATTTT
GAACGTGCAAAAAAAATTACCAATAATCCAGAAAATTATTATCATGGATTCTAAAACGGA
TTACCAGGGATTTCAGTCGATGTACACGTTCGTCACATCTCATCTACCTCCCGGTTTTAA
TGAATACGATTTTGTACCAGAGTCCTTTGATCGTGACAAAACAATTGCACTGATAATGAA
TTCCTCTGGATCTACTGGGTTACCTAAGGGTGTGGCCCTTCCGCATAGAACTGCCTGCGT
CAGATTCTCGCATGCCAGAGATCCTATTTTTGGCAATCAAATCATTCCGGATACTGCGAT
TTTAAGTGTTGTTCCATTCCATCACGGTTTTGGAATGTTTACTACACTCGGATATTTGAT
ATGTGGATTTCGAGTCGTCTTAATGTATAGATTTGAAGAAGAGCTGTTTTTACGATCCCT
TCAGGATTACAAAATTCAAAGTGCGTTGCTAGTACCAACCCTATTTTCATTCTTCGCCAA
AAGCACTCTGATTGACAAATACGATTTATCTAATTTACACGAAATTGCTTCTGGGGGCGC
ACCTCTTTCGAAAGAAGTCGGGGAAGCGGTTGCAAAACGCTTCCATCTTCCAGGGATACG
ACAAGGATATGGGCTCACTGAGACTACATCAGCTATTCTGATTACACCCGAGGGGGATGA
TAAACCGGGCGCGGTCGGTAAAGTTGTTCCATTTTTTGAAGCGAAGGTTGTGGATCTGGA
TACCGGGAAAACGCTGGGCGTTAATCAGAGAGGCGAATTATGTGTCAGAGGACCTATGAT
TATGTCCGGTTATGTAAACAATCCGGAAGCGACCAACGCCTTGATTGACAAGGATGGATG
GCTACATTCTGGAGACATAGCTTACTGGGACGAAGACGAACACTTCTTCATAGTTGACCG
CTTGAAGTCTTTAATTAAATACAAAGGATATCAGGTGGCCCCCGCTGAATTGGAATCGAT
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CGGTGAACTTCCCGCCGCCGTTGTTGTTTTGGAGCACGGAAAGACGATGACGGAAAAAGA
GATCGTGGATTACGTCGCCAGTCAAGTAACAACCGCGAAAAAGTTGCGCGGAGGAGTTGT
GTTTGTGGACGAAGTACCGAAAGGTCTTACCGGAAAACTCGACGCAAGAAAAATCAGAGA
GATCCTCATAAAGGCCAAGAAGGGCGGAAAGATCGCCGTGTAATTCTAGAAGATCCCGTT
TTTCTTACTTATATATTTATACCAATTGATTGTATTTATAACTGTAAAAATGTGTATGTT
GTGTGCATATTTTTTTTTGTGCATGCACATGCATGTAAATAGCTAAAATTATGAACATTT
TATTTTTTGTTCAGAAAAAAAAAACTTTACACACATAAAATGGCTAGTATGAATAGCCAT
ATTTTATATAAATTAAATCCTATGAATTTATGACCATATTAAAAATTTAGATATTTATGG
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TGAAATAGATACAATTCATTCATGTTATATACATCTAGAACATAATCTGAATATGGTTCA
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TAAAAATAAAATGTTCAAAGAAAAAGGACATTTCACTTTTGTTACTCCATTAATTGTAGA
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TGGATGTGACTTTTCAGGTAATTCTAAAAAAACATTTTACTATTCCAATGTTTATGATTT
AGAAAAAAAAAATGAGTTTTGTGAAATAGAATTAAAAGAAAATATAGTAGTTAGCTTAAA
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TGCAGATTATTTTATAAATAATTCATCAACCTTTTTGATGATTTCCAAAATTACAAAAAA
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GTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGCCTTGCAGCACATCCCCCTT
TCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGATCGCCCTTCCCAACAGTTGCGCA
GCCTGAATGGCGAATGGCGCCTGATGCGGTATTTTCTCCTTACGCATCTGTGCGGTATTT
CACACCGCATATGGTGCACTCTCAGTACAATCTGCTCTGATGCCGCATAGTTAAGCCAGC
CCCGACACCCGCCAACACCCGCTGACGCGCCCTGACGGGCTTGTCTGCTCCCGGCATCCG
CTTACAGACAAGCTGTGACCGTCTCCGGGAGCTGCATGTGTCAGAGGTTTTCACCGTCAT
CACCGAAACGCGCGAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCA
TGATAATAATGGTTTCTTAGACGTCAGGTGGCACTTTTCGGGGAAATGTGCGCGGAACCC
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TGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCGCTCGGCCCTTCCGGCTGGCTGGTTTA
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CAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGG
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CAGACCAAGTTTACTCATATATACTTTAGATTGATTTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAA
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CGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTT
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TGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGA
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CACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATA
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GCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGA
GATACCTACAGCGTGAGCATTGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACA
GGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAA
ACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTT
TGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTAC
GGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATT
CTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCGAACGA
CCGAGCGCAGCGAGTCAGTGAGCGAGGAAGCGGAAGAGCGCCCAATACGCAAACCGCCTC
TCCCCGCGCGTTGGCCGATTCATTAATGCAGCTGGCACGACAGGTTTCCCGACTGGAAAG
CGGGCAGTGAGCGCAACGCAATTAATGTGAGTTAGCTCACTCATTAGGCACCCCAGGCTT
TACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACA
CAGGAAACAGCTATGACCATGATTACGCCAAGCTTCCGCGGGTATATGGTAAAGAACCTA
CTAACACAATAAAATATTTAAATAATGTATTTCCTATAAATAAATTTACAGATTTATTTT
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TTATGACATCATTTATAAATCATGGATCATATCCACTAACAATAGAATGTGGTGTAACAA
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AAGATGAAATATATGATTATAATGATTTTCCAATGGTGAATCACAAACCTATTATTGCAC
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CGTTGTCATGGGACGGAAAACCTGGGAAAGCATGCCTCGAAAGTTTAGACCCCTCGTGGA
CAGATTGAACATCGTCGTTTCCTCTTCCCTCAAAGAAGAAGACATTGCGGCGGAGAAGCC
TCAAGCTGAAGGCCAGCAGCGCGTCCGAGTCTGTGCTTCACTCCCAGCAGCTCTCAGCCT
TCTGGAGGAAGAGTACAAGGATTCTGTCGACCAGATTTTTGTCGTGGGAGGAGCGGGACT
GTACGAGGCAGCGCTGTCTCTGGGCGTTGCCTCTCACCTGTACATCACGCGTGTAGCCCG
CGAGTTTCCGTGCGACGTTTTCTTCCCTGCGTTCCCCGGAGATGACATTCTTTCAAACAA
ATCAACTGCTGCGCAGGCTGCAGCTCCTGCCGAGTCTGTGTTCGTTCCCTTTTGTCCGGA
GCTCGGAAGAGAGAAGGACAATGAAGCGACGTATCGACCCATCTTCATTTCCAAGACCTT
CTCAGACAACGGGGTTCCCTACGACTTTGTGGTTC
|
Restriction sites to linearize plasmid |
KspI (SacII)
|
Selectable marker used to select the mutant parasite | tgdhfr |
Promoter of the selectable marker | pbdhfr |
Selection (positive) procedure | pyrimethamine |
Selection (negative) procedure | No |
Additional remarks genetic modification | |
Additional remarks selection procedure | |
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Other details transgene |
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Promoter |
Gene Model of Parasite |
PBANKA_1326400
|
Gene Model P. falciparum ortholog |
PF3D7_1462800
|
Gene product | glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase |
Gene product: Alternative name | |
Primer information details of the primers used for amplification of the promoter sequence
Primer information details of the primers used for amplification of the promoter sequence
Sequence Primer 1 | ATAAGAATGCGGCCGCGTATAAACTGAGTTAAGGGAAGTGG |
Additional information primer 1 | 2607 (NotI); glyc promoter sense |
Sequence Primer 2 | CATGCCATGGTTTTATGTTTTTTTAAAATATTATATTGCTTG |
Additional information primer 2 | 2608 (NcoI); glyc promoter antisense |
|
|
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3'-UTR |
Gene Model of Parasite |
PBANKA_0719300
|
Gene product | bifunctional dihydrofolate reductase-thymidylate synthase, putative |
Gene product: Alternative name | dhfr/ts |
Primer information details of the primers used for amplification the 3'-UTR sequences
Primer information details of the primers used for amplification the 3'-UTR sequences
Sequence Primer 1 | |
Additional information primer 1 | |
Sequence Primer 2 | |
Additional information primer 2 | |
|
|
Insertion/Replacement locus |
Replacement / Insertion | Replacement locus |
Gene Model of Parasite |
PBANKA_0306000
|
Gene product | 6-cysteine protein |
Gene product: Alternative name | 230p |
Primer information details of the primers used for amplification of the target sequences
Primer information details of the primers used for amplification of the target sequences
Sequence Primer 1 | |
Additional information primer 1 | |
Sequence Primer 2 | |
Additional information primer 2 | |
Sequence Primer 3 | |
Additional information primer 3 | |
Sequence Primer 4 | |
Additional information primer 4 | |
|
|
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