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Type and details of transgene |
Is the transgene Plasmodium derived |
Transgene: not Plasmodium |
Transgene name | GFP-Luciferase |
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Details of the genetic modification |
Inducable system used | No |
Additional remarks inducable system |
|
Type of plasmid/construct | Plasmid double cross-over |
PlasmoGEM (Sanger) construct/vector used | No |
Modified PlasmoGEM construct/vector used | No
|
Plasmid/construct map |
|
Plasmid/construct sequence |
TCGAGAAGAGAAGGAAGACTGACGACGCAGCCACTGCGGAACCGAGCAACGCAATGAGCT
CCTTGACGTCCACGAGGGAGACAACTCCCGTGCACGGGTTGCAGGCTCCTTCTTCGGCCG
CAGCCATTGCCCCGGTGTTGGCGTGGATGGACGAAGAAGACCGGAAAAAACGCGAGCAAA
AGGAACTGATTCGGGCCGTTCCGCATGTTCACTTTAGAGGCCATGAAGAGTTCCAGTACC
TTGATCTCATTGCCGACATTATTAACAATGGAAGGACAATGGATGACCGAACGGGCGTTG
GTGTCATCTCCAAATTCGGCTGCACTATGCGCTACTCGCTGGATCAGGCCTTTCCACTTC
TCACCACAAAGCGTGTGTTCTGGAAAGGGGTCCTCGAAGAGTTGCTGTGGTTCATTCGCG
GCGACACGAACGCAAACCATCTTTCTGAGAAGGGCGTGAAGATCTGGGACAAGAATGTGA
CACGCGAGTTCCTCGATTCGCGCAATCTCCCCCACCGAGAGGTCGGAGACATCGGCCCGG
GCTACGGCTTCCAGTGGAGACACTTCGGCGCGGCATACAAAGACATGCACACAGACTACA
CAGGGCAGGGCGTCGACCAGCTGAAGAATGTGATCCAGATGCTGAGAACGAATCCAACAG
ATCGTCGCATGCTCATGACTGCCTGGAATCCTGCAGCGCTGGACGAAATGGCGCTGCCGC
CTTGTCACTTGTTGTGCCAGTTCTACGTGAACGACCAGAAGGAGCTGTCGTGCATCATGT
ATCAGCGGTCGTGCGATGTCGGCCTCGGCGTCCCCTTCAACATCGCTTCCTATTCGCTTT
TGACGCTCATGGTTGCACACGTCTGCAACCTAAAACCTAAGGAGTTCATTCACTTCATGG
GGAACACGCATGTCTACACGAACCATGTCGAGGCTTTAAAAGAGCAGCTGCGGAGAGAAC
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GTGCATGCACATGCATGTAAATAGCTAAAATTATGAACATTTTATTTTTTGTTCAGAAAA
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GTTAGTATATTAACAAAATTTAATATTTTGTATGTTTTAAGGTAATTTCATTTACTACAT
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GTTGTAAGGCTCCTATTAAATATTTTAATTATTTTAGAACAACACATATAATTACCATAT
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AAAAACACACTTAGGCATTGAAATGTGTTTTAATGTTTTTTCATTCAACGTAATAATATG
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ACTACTGGAAAACTACCTGTTCCTTGGCCAACACTTGTCACTACTTTCGGTTATGGTGTT
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CACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATT
GGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCG
AAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGG
ATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAAGGGATCCTGGCTAGCCAGTCGACCTGCAGG
CATGCAAGCTTGCGGCCGATCCAAATGGAAGACGCCAAAAACATAAAGAAAGGCCCGGCG
CCATTCTATCCGCTGGAAGATGGAACCGCTGGAGAGCAACTGCATAAGGCTATGAAGAGA
TACGCCCTGGTTCCTGGAACAATTGCTTTTACAGATGCACATATCGAGGTGAACATCACG
TACGCGGAATACTTCGAAATGTCCGTTCGGTTGGCAGAAGCTATGAAACGATATGGGCTG
AATACAAATCACAGAATCGTCGTATGCAGTGAAAACTCTCTTCAATTCTTTATGCCGGTG
TTGGGCGCGTTATTTATCGGAGTTGCAGTTGCGCCCGCGAACGACATTTATAATGAACGT
GAATTGCTCAACAGTATGAACATTTCGCAGCCTACCGTAGTGTTTGTTTCCAAAAAGGGG
TTGCAAAAAATTTTGAACGTGCAAAAAAAATTACCAATAATCCAGAAAATTATTATCATG
GATTCTAAAACGGATTACCAGGGATTTCAGTCGATGTACACGTTCGTCACATCTCATCTA
CCTCCCGGTTTTAATGAATACGATTTTGTACCAGAGTCCTTTGATCGTGACAAAACAATT
GCACTGATAATGAATTCCTCTGGATCTACTGGGTTACCTAAGGGTGTGGCCCTTCCGCAT
AGAACTGCCTGCGTCAGATTCTCGCATGCCAGAGATCCTATTTTTGGCAATCAAATCATT
CCGGATACTGCGATTTTAAGTGTTGTTCCATTCCATCACGGTTTTGGAATGTTTACTACA
CTCGGATATTTGATATGTGGATTTCGAGTCGTCTTAATGTATAGATTTGAAGAAGAGCTG
TTTTTACGATCCCTTCAGGATTACAAAATTCAAAGTGCGTTGCTAGTACCAACCCTATTT
TCATTCTTCGCCAAAAGCACTCTGATTGACAAATACGATTTATCTAATTTACACGAAATT
GCTTCTGGGGGCGCACCTCTTTCGAAAGAAGTCGGGGAAGCGGTTGCAAAACGCTTCCAT
CTTCCAGGGATACGACAAGGATATGGGCTCACTGAGACTACATCAGCTATTCTGATTACA
CCCGAGGGGGATGATAAACCGGGCGCGGTCGGTAAAGTTGTTCCATTTTTTGAAGCGAAG
GTTGTGGATCTGGATACCGGGAAAACGCTGGGCGTTAATCAGAGAGGCGAATTATGTGTC
AGAGGACCTATGATTATGTCCGGTTATGTAAACAATCCGGAAGCGACCAACGCCTTGATT
GACAAGGATGGATGGCTACATTCTGGAGACATAGCTTACTGGGACGAAGACGAACACTTC
TTCATAGTTGACCGCTTGAAGTCTTTAATTAAATACAAAGGATATCAGGTGGCCCCCGCT
GAATTGGAATCGATATTGTTACAACACCCCAACATCTTCGACGCGGGCGTGGCAGGTCTT
CCCGACGATGACGCCGGTGAACTTCCCGCCGCCGTTGTTGTTTTGGAGCACGGAAAGACG
ATGACGGAAAAAGAGATCGTGGATTACGTCGCCAGTCAAGTAACAACCGCGAAAAAGTTG
CGCGGAGGAGTTGTGTTTGTGGACGAAGTACCGAAAGGTCTTACCGGAAAACTCGACGCA
AGAAAAATCAGAGAGATCCTCATAAAGGCCAAGAAGGGCGGAAAGATCGCCGTGTAATTC
TAGAAGATCCCGTTTTTCTTACTTATATATTTATACCAATTGATTGTATTTATAACTGTA
AAAATGTGTATGTTGTGTGCATATTTTTTTTTGTGCATGCACATGCATGTAAATAGCTAA
AATTATGAACATTTTATTTTTTGTTCAGAAAAAAAAAACTTTACACACATAAAATGGCTA
GTATGAATAGCCATATTTTATATAAATTAAATCCTATGAATTTATGACCATATTAAAAAT
TTAGATATTTATGGAACATAATATGTTTGAAACAATAAGACAAAATTATTATTATTATTA
TTATTTTTACTGTTATAATTATGTTGTCTCTTCAATGATTCATAAATAGTTGGACTTGAT
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CTTGAGCCCGTTAATGAAATAGATACAATTCATTCATGTTATATACATCTAGAACATAAT
CTGAATATGGTTCAAGTTAAATGTCCAAAAATTATAAAAAGTGATGATATTTTTGATGGT
AATACCATAATAGACACCAAGGTAACATCACGAAGTAGTCAACAAAATAATTTTTATTTA
GAAAATACAGATGTTGAACCAGAAGAAATAGAGAAATATAAAAATATAGAATACATACCA
GAAAACGATGAAGTAATGCATCTAGACAAAAAAGAAAAGCTAGATGATATATTACCAGGT
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GTAGTTAGCTTAAATTGTCCAACTGGTAAAATTAATCCAAAAAATTGTTTTAGAAATGTA
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ATAAAAGTTATAGATGCAGATTATTTTATAAATAATTCATCAACCTTTTTGATGATTTCC
AAAATTACAAAAAAAGAGTTTGATTTTTATTGTACATGTGAAGATTATAAAACCAAAAAT
ATAGGAACAATATATATTAAAAATTATGAATATCTAGATTCAAAACCTAAATATAAAAAT
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AGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGATCGCCCTTC
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GCTCCCGGCATCCGCTTACAGACAAGCTGTGACCGTCTCCGGGAGCTGCATGTGTCAGAG
GTTTTCACCGTCATCACCGAAACGCGCGAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTT
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GGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAACTACTTACTCTAGCTTCCCGGCAACA
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CAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTCCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTT
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TGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAA
GGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGAC
CTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCATTGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGG
GAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGA
GCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACT
TGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAA
CGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTTTCCTGC
GTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCG
CCGCAGCCGAACGACCGAGCGCAGCGAGTCAGTGAGCGAGGAAGCGGAAGAGCGCCCAAT
ACGCAAACCGCCTCTCCCCGCGCGTTGGCCGATTCATTAATGCAGCTGGCACGACAGGTT
TCCCGACTGGAAAGCGGGCAGTGAGCGCAACGCAATTAATGTGAGTTAGCTCACTCATTA
GGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGG
ATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGACCATGATTACGCCAAGCTTCCGCGGGTATA
TGGTAAAGAACCTACTAACACAATAAAATATTTAAATAATGTATTTCCTATAAATAAATT
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TGGCTTCCCAGGAAATTTGCAAAGACGGGCGACTCTGGACTTCCCTCTCCATCAGTCGGC
AAGAGATTCAACGCCGTTGTCATGGGACGGAAAACCTGGGAAAGCATGCCTCGAAAGTTT
AGACCCCTCGTGGACAGATTGAACATCGTCGTTTCCTCTTCCCTCAAAGAAGAAGACATT
GCGGCGGAGAAGCCTCAAGCTGAAGGCCAGCAGCGCGTCCGAGTCTGTGCTTCACTCCCA
GCAGCTCTCAGCCTTCTGGAGGAAGAGTACAAGGATTCTGTCGACCAGATTTTTGTCGTG
GGAGGAGCGGGACTGTACGAGGCAGCGCTGTCTCTGGGCGTTGCCTCTCACCTGTACATC
ACGCGTGTAGCCCGCGAGTTTCCGTGCGACGTTTTCTTCCCTGCGTTCCCCGGAGATGAC
ATTCTTTCAAACAAATCAACTGCTGCGCAGGCTGCAGCTCCTGCCGAGTCTGTGTTCGTT
CCCTTTTGTCCGGAGCTCGGAAGAGAGAAGGACAATGAAGCGACGTATCGACCCATCTTC
ATTTCCAAGACCTTCTCAGACAACGGGGTTCCCTACGACTTTGTGGTTC
|
Restriction sites to linearize plasmid |
KspI (SacII)
|
Selectable marker used to select the mutant parasite | tgdhfr |
Promoter of the selectable marker | pbdhfr |
Selection (positive) procedure | pyrimethamine |
Selection (negative) procedure | No |
Additional remarks genetic modification | |
Additional remarks selection procedure | |
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Other details transgene |
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Promoter |
Gene Model of Parasite |
PBANKA_1128100
|
Gene Model P. falciparum ortholog |
PF3D7_0629300
|
Gene product | phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, putative | phospholipase, putative |
Gene product: Alternative name | PL, phospholipase; UIS10 |
Primer information details of the primers used for amplification of the promoter sequence
Primer information details of the primers used for amplification of the promoter sequence
Sequence Primer 1 | CGGATATCGCGGCCGCGAGTATAGGATAGATAATTTTTTTTGTGG |
Additional information primer 1 | 2603 (EcoRV/NotI); UIS10 promoter sense |
Sequence Primer 2 | CGGGATCCCCATGGTCTTTCACATTTACGCCAATAATTTTTTTAATG |
Additional information primer 2 | 2604 (NcoI/BamHI); UIS10 promoter antisense |
|
|
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3'-UTR |
Gene Model of Parasite |
PBANKA_0719300
|
Gene product | bifunctional dihydrofolate reductase-thymidylate synthase, putative |
Gene product: Alternative name | dhfr/ts |
Primer information details of the primers used for amplification the 3'-UTR sequences
Primer information details of the primers used for amplification the 3'-UTR sequences
Sequence Primer 1 | |
Additional information primer 1 | |
Sequence Primer 2 | |
Additional information primer 2 | |
|
|
Insertion/Replacement locus |
Replacement / Insertion | Replacement locus |
Gene Model of Parasite |
PBANKA_0306000
|
Gene product | 6-cysteine protein |
Gene product: Alternative name | 230p |
Primer information details of the primers used for amplification of the target sequences
Primer information details of the primers used for amplification of the target sequences
Sequence Primer 1 | |
Additional information primer 1 | |
Sequence Primer 2 | |
Additional information primer 2 | |
Sequence Primer 3 | |
Additional information primer 3 | |
Sequence Primer 4 | |
Additional information primer 4 | |
|
|
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