SummaryRMgm-354
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Successful modification | The parasite was generated by the genetic modification | ||||||||||||||||||||||||
The mutant contains the following genetic modification(s) | Gene disruption | ||||||||||||||||||||||||
Reference (PubMed-PMID number) |
Reference 1 (PMID number) : 20386715 | ||||||||||||||||||||||||
MR4 number | |||||||||||||||||||||||||
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Parent parasite used to introduce the genetic modification | |||||||||||||||||||||||||
Rodent Malaria Parasite | P. berghei | ||||||||||||||||||||||||
Parent strain/line | P. berghei ANKA | ||||||||||||||||||||||||
Name parent line/clone | P. berghei ANKA cl15cy1 | ||||||||||||||||||||||||
Other information parent line | A reference wild type clone from the ANKA strain of P. berghei (PubMed: PMID: 17406255). | ||||||||||||||||||||||||
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The mutant parasite was generated by | |||||||||||||||||||||||||
Name PI/Researcher | M.R. van Dijk; C.J. Janse | ||||||||||||||||||||||||
Name Group/Department | Leiden Malaria Research Group | ||||||||||||||||||||||||
Name Institute | Leiden University Medical Center | ||||||||||||||||||||||||
City | Leiden | ||||||||||||||||||||||||
Country | The Netherlands | ||||||||||||||||||||||||
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Name of the mutant parasite | |||||||||||||||||||||||||
RMgm number | RMgm-354 | ||||||||||||||||||||||||
Principal name | 360cl1; 846cl1 (in 507cl1 background) | ||||||||||||||||||||||||
Alternative name | Δp38 | ||||||||||||||||||||||||
Standardized name | |||||||||||||||||||||||||
Is the mutant parasite cloned after genetic modification | Yes | ||||||||||||||||||||||||
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Phenotype | |||||||||||||||||||||||||
Asexual blood stage | Not different from wild type | ||||||||||||||||||||||||
Gametocyte/Gamete | Not different from wild type | ||||||||||||||||||||||||
Fertilization and ookinete | Not different from wild type | ||||||||||||||||||||||||
Oocyst | Not different from wild type | ||||||||||||||||||||||||
Sporozoite | Not different from wild type | ||||||||||||||||||||||||
Liver stage | Not different from wild type | ||||||||||||||||||||||||
Additional remarks phenotype | Mutant/mutation Phenotype Table: P. falciparum gene members of the 6-cys family
Other mutants |
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Details of the target gene | |||||||||||||||||||||||||
Gene Model of Rodent Parasite | PBANKA_1107600 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Model P. falciparum ortholog | PF3D7_0508000 | ||||||||||||||||||||||||
Gene product | 6-cysteine protein | ||||||||||||||||||||||||
Gene product: Alternative name | P38, Pf38 | ||||||||||||||||||||||||
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Details of the genetic modification | |||||||||||||||||||||||||
Inducable system used | No | ||||||||||||||||||||||||
Additional remarks inducable system | |||||||||||||||||||||||||
Type of plasmid/construct used | Plasmid double cross-over | ||||||||||||||||||||||||
PlasmoGEM (Sanger) construct/vector used | No | ||||||||||||||||||||||||
Modified PlasmoGEM construct/vector used | No | ||||||||||||||||||||||||
Plasmid/construct map | |||||||||||||||||||||||||
Plasmid/construct sequence | |||||||||||||||||||||||||
Restriction sites to linearize plasmid | ClaI, BamHI | ||||||||||||||||||||||||
Partial or complete disruption of the gene | Partial | ||||||||||||||||||||||||
Additional remarks partial/complete disruption | 163bp upstream of coding region and 63 bp of the coding region were disrupted | ||||||||||||||||||||||||
Selectable marker used to select the mutant parasite | tgdhfr | ||||||||||||||||||||||||
Promoter of the selectable marker | pbdhfr | ||||||||||||||||||||||||
Selection (positive) procedure | pyrimethamine | ||||||||||||||||||||||||
Selection (negative) procedure | No | ||||||||||||||||||||||||
Additional remarks genetic modification | |||||||||||||||||||||||||
Additional remarks selection procedure | |||||||||||||||||||||||||
Primer information: Primers used for amplification of the target sequences
Primer information: Primers used for amplification of the target sequences
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